Corrected license

Code/include/Animation/AnimatedMesh.hpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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 //
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+#ifndef ANIMATEDMESH_HPP
+#define ANIMATEDMESH_HPP
 
 #include <vector>
 #include <unordered_map>

Code/include/Animation/Animation.hpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+#ifndef ANIMATION_HPP
+#define ANIMATION_HPP
 
 //////////////////////////////////////////////
 /// \defgroup animation Animation module

Code/include/Animation/Click.hpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+#ifndef CLICK_HPP
+#define CLICK_HPP
 
 #include <vector>
 #include <Geometry/MathFunctions.hpp>

Code/include/Animation/Menu.hpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+#ifndef MENU_HPP
+#define MENU_HPP
 
 #include <memory>
 

Code/include/Calibration/Calibration.hpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+#ifndef CALIBRATION_HPP
+#define CALIBRATION_HPP
 
 /////////////////////////////////////////////////////
 /// \defgroup calibration Calibration

Code/include/DetectionAndMatching/DetectionAndMatching.hpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+#ifndef DETECTIONANDMATCHING_HPP
+#define DETECTIONANDMATCHING_HPP
 
 /////////////////////////////////////////////////////////
 /// \defgroup detectionandmatching Detection and Matching module
 ///
 /// Contains all the functions to compute the keypoints and
 /// match them on differents images. The algorithm used
-/// to detect the keypoints and compute the descriptors is BRISK. 
-/// The matches are computed with a brute force matcher provided 
+/// to detect the keypoints and compute the descriptors is BRISK.
+/// The matches are computed with a brute force matcher provided
 /// by OpenCV.
 ///
 /// This program is meant to be used like this

Code/include/Extern/Camera.hpp

@@ -28,6 +28,8 @@
 //
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 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+#ifndef _CAMERA_HPP_
+#define _CAMERA_HPP_
 
 #include <opencv2/core/core.hpp>
 

Code/include/Extern/ChessboardCameraTracker.hpp

@@ -28,6 +28,8 @@
 //
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+#ifndef _CHESSBOARDCAMERATRACKER_HPP_
+#define _CHESSBOARDCAMERATRACKER_HPP_
 
 #include "Camera.hpp"
 #include "utility.hpp"

Code/include/Extern/utility.hpp

@@ -28,6 +28,8 @@
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+#ifndef _UTILITY_HPP_
+#define _UTILITY_HPP_
 
 #include "Camera.hpp"
 

Code/include/Geometry/Base.hpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+#ifndef BASE_HPP
+#define BASE_HPP
 
 #include <vector>
 #include <Geometry/Vector.hpp>

Code/include/Geometry/Circle.hpp

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+//
 // Paella
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+#ifndef CIRCLE_HPP
+#define CIRCLE_HPP
 
 #include <vector>
 #include <utility>

Code/include/Geometry/Geometry.hpp

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+//
 // Paella
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+#ifndef GEOMETRY_HPP
+#define GEOMETRY_HPP
 
 
 #include<Base.hpp>

Code/include/Geometry/MathFunctions.hpp

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+//
 // Paella
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+#ifndef MATHFUNCTIONS_HPP
+#define MATHFUNCTIONS_HPP
 
 #include <vector>
 

Code/include/Geometry/MathFunctions.inl

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+//
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+#include <limits>
+
 #include <opencv2/features2d/features2d.hpp>
 
 #include "Geometry/Vector.hpp"

Code/include/Geometry/Mesh.hpp

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+//
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+#ifndef MESH_HPP
+#define MESH_HPP
 
 #include <vector>
 #include <Geometry/Spline.hpp>

Code/include/Geometry/Point.hpp

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 // Paella
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+#ifndef POINT_HPP
+#define POINT_HPP
 
 #include <utility>
 

Code/include/Geometry/Rotation.hpp

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 // Paella
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+#ifndef ROTATION_HPP
+#define ROTATION_HPP
 
 #include <GL/gl.h>
 #include <Geometry/Vector.hpp>

Code/include/Geometry/Spline.hpp

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+//
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+#ifndef SPLINE_HPP
+#define SPLINE_HPP
 
 #include <vector>
 #include <tuple>

Code/include/Geometry/Spline.inl

@@ -1,5 +1,5 @@
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-// 
+//
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+#include <iostream>
+#include <fstream>
 #include <sstream>
 #include <cmath>
 #include "Geometry/Vector.hpp"

Code/include/Geometry/Tree.hpp

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+//
 // Paella
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+#ifndef TREE_HPP
+#define TREE_HPP
 
 #include <iostream>
 #include <vector>

Code/include/Geometry/Vector.hpp

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-// 
+//
 // Paella
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+#ifndef VECTOR_HPP
+#define VECTOR_HPP
 
 #include <cmath>
 #include <array>

Code/include/Geometry/Vector.inl

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-// 
+//
 // Paella
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+#include <iostream>
+#include <cmath>
 #include "Geometry/Vector.hpp"
 
 namespace geo

Code/include/Meshing/Meshing.hpp

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-// 
+//
 // Paella
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+#ifndef MESHING_HPP
+#define MESHING_HPP
 
 //////////////////////////////////////////////////
 /// \defgroup meshing Meshing module

Code/include/Meshing/Skeleton3D.hpp

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-// 
+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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+#ifndef SKELETON3D_HPP
+#define SKELETON3D_HPP
 
 #include <vector>
 #include <list>

Code/include/Meshing/Skeleton3D.inl

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-// 
+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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+#include <iostream>
+#include <fstream>
 #include <sstream>
 #include <cmath>
 #include <list>

Code/include/SFMLTools/Camera.hpp

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-// 
+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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+#ifndef CAMERA_HPP
+#define CAMERA_HPP
 
 namespace sft
 {

Code/include/SFMLTools/FreeFlyCamera.hpp

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-// 
+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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+#ifndef FREE_FLY_CAMERA_HPP
+#define FREE_FLY_CAMERA_HPP
 
 #include <SFML/System/Vector3.hpp>
 #include <SFML/Window/Event.hpp>

Code/include/SFMLTools/JoyCam.hpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+#ifndef JOY_CAM_HPP
+#define JOY_CAM_HPP
 
 #include <SFML/System/Vector3.hpp>
 #include <SFML/Window/Event.hpp>

Code/include/SFMLTools/SFMLTools.hpp

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-// 
+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+#ifndef SFML_TOOLS_HPP
+#define SFML_TOOLS_HPP
 
 ///////////////////////////////////////////////////////////
 /// \defgroup sfmltools SFML Tools

Code/include/SFMLTools/VectorFunctions.hpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+#ifndef VECTOR_FUNCTIONS_HPP
+#define VECTOR_FUNCTIONS_HPP
 
 #include <cmath>
 #include <SFML/System/Vector2.hpp>

Code/include/Skeleton/Box.hpp

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-// 
+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+#ifndef BOX_HPP
+#define BOX_HPP
 
 class Box
 {

Code/include/Skeleton/Branch.hpp

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+//
 // Paella
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+#ifndef BRANCH_HPP
+#define BRANCH_HPP
 
 #include <vector>
 

Code/include/Skeleton/Skeleton.hpp

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-// 
+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+#ifndef SKELETON_HPP
+#define SKELETON_HPP
 
 #include <string>
 #include <vector>

Code/include/Skeleton/VectorFunctions.hpp

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+//
 // Paella
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+#ifndef VECTOR_FUNCTIONS_HPP
+#define VECTOR_FUNCTIONS_HPP
 
 #include <cmath>
 #include <SFML/System/Vector3.hpp>

Code/include/Utility/TupleFunctions.hpp

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+//
 // Paella
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+#ifndef TUPLEFUNCTIONS_HPP
+#define TUPLEFUNCTIONS_HPP
 
 #include <sstream>
 #include <tuple>

Code/include/Utility/TupleFunctions.inl

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+//
 // Paella
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+#include <iostream>
+
 #include "TupleFunctions.hpp"
 
 namespace pae

Code/include/Utility/Utility.hpp

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-// 
+//
 // Paella
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+#ifndef UTILITY_HPP
+#define UTILITY_HPP
 
 //////////////////////////////////////////////////////
 /// \defgroup utility Utility module

Code/src/Animation/AnimatedMain.cpp

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-// 
+//
 // Paella
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+#include <iostream>
+#include <vector>
 #include <memory>
 #include <cmath>
 #include <SFML/Window.hpp>

Code/src/Animation/AnimatedMesh.cpp

@@ -1,5 +1,5 @@
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-// 
+//
 // Paella
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 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+#include <GL/glu.h>
+
 #include <Animation/AnimatedMesh.hpp>
 #include <Animation/Click.hpp>
 

Code/src/Animation/Click.cpp

@@ -1,5 +1,5 @@
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-// 
+//
 // Paella
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+#include <Animation/Click.hpp>
+#include <SFML/Window.hpp>
 #include <SFML/Graphics.hpp>
 #include <SFML/System.hpp>
 #include <SFMLTools/VectorFunctions.hpp>

Code/src/Animation/MainClick.cpp

@@ -1,5 +1,5 @@
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-// 
+//
 // Paella
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+#include <iostream>
+#include <Animation/Click.hpp>
 #include <Meshing/Skeleton3D.hpp>
 
 int main(int argc, char** argv)

Code/src/Animation/Menu.cpp

@@ -1,5 +1,5 @@
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-// 
+//
 // Paella
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+#include <iostream>
+#include <cmath>
 #include <boost/lexical_cast.hpp>
 
 #include <Animation/Menu.hpp>

Code/src/Calibration/Calibration.cpp

@@ -14,6 +14,7 @@
 //     Marion LENFANT
 //     Thierry MALON
 //     Amandine PAILLOUX
+//     Simone GASPARINI
 //
 // This file is part of the project Paella
 // This software is provided 'as-is', without any express or implied warranty.
@@ -33,6 +34,8 @@
 //
 // 3. This notice may not be removed or altered from any source distribution.
 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+
+#include "opencv2/core/core.hpp"
 #include "opencv2/imgproc/imgproc.hpp"
 #include "opencv2/calib3d/calib3d.hpp"
 #include "opencv2/highgui/highgui.hpp"

Code/src/DetectionAndMatching/DetectionAndMatching.cpp

@@ -1,5 +1,5 @@
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-// 
+//
 // Paella
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+#include <iostream>
+#include <cmath>
 #include <tuple>
 #include <algorithm>
 

Code/src/Extern/Camera.cpp

@@ -28,6 +28,8 @@
 //
 // 3. This notice may not be removed or altered from any source distribution.
 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+#include "Extern/Camera.hpp"
+
 #include <iostream>
 
 /**

Code/src/Extern/ChessboardCameraTracker.cpp

@@ -28,6 +28,8 @@
 //
 // 3. This notice may not be removed or altered from any source distribution.
 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+#include "Extern/ChessboardCameraTracker.hpp"
+#include "Extern/utility.hpp"
 
 #include <opencv2/highgui/highgui.hpp>
 #include <opencv2/calib3d/calib3d.hpp>

Code/src/Extern/main.cpp

@@ -28,6 +28,8 @@
 //
 // 3. This notice may not be removed or altered from any source distribution.
 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+#include "Extern/ChessboardCameraTracker.hpp"
+#include "Extern/utility.hpp"
 
 #include <opencv2/core/core.hpp>
 #include <opencv2/imgproc/imgproc.hpp>

Code/src/Extern/utility.cpp

@@ -28,6 +28,8 @@
 //
 // 3. This notice may not be removed or altered from any source distribution.
 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
+#include "Extern/utility.hpp"
+
 #include <opencv2/calib3d/calib3d.hpp>
 #include <opencv2/imgproc/imgproc.hpp>
 

Code/src/Geometry/Base.cpp

@@ -1,5 +1,5 @@
 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-// 
+//
 // Paella
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+#include <cmath>
+#include <iostream>
 
 #include <Geometry/Base.hpp>
 

Code/src/Geometry/Mesh.cpp

@@ -1,5 +1,5 @@
 ////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
-// 
+//
 // Paella
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@@ -27,6 +27,8 @@
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+#include <iostream>
+#include <fstream>
 #include <sstream>
 #include <GL/gl.h>
 

Code/src/Geometry/ProjectionTest.cpp

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-// 
+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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 //
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+#include <iostream>
+#include <vector>
 #include <Geometry/Vector.hpp>
 #include <Geometry/MathFunctions.hpp>
 

Code/src/Geometry/Rotation.cpp

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-// 
+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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 //
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+#include <Geometry/Rotation.hpp>
+
 namespace geo
 {
 

Code/src/HelloCV/HelloCV.cpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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+#include <opencv2/highgui/highgui.hpp>
+#include <opencv2/imgproc/imgproc.hpp>
 
 #ifdef _WIN32
     #define CV_ESCAPE 27

Code/src/Meshing/CirclePlane.cpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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+#include <iostream>
+#include <vector>
 #include <memory>
 #include <cmath>
 #include <SFML/Window.hpp>

Code/src/Meshing/Circles.cxx

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-// 
+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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+auto c1 = geo::Circle<float>{};
+c1.center = geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.0000f, 0.0000f};
 c1.points.push_back(std::make_pair(0,  geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.0000f, 1.0000f}));
 c1.points.push_back(std::make_pair(1,  geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.5878f, 0.8090f}));
 c1.points.push_back(std::make_pair(2,  geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.9511f, 0.3090f}));

Code/src/Meshing/Circles1.cxx

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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+auto c1 = geo::Circle<float>{};
+c1.center = geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.0000f, 0.0000f};
 c1.points.push_back(std::make_pair(0, geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.0000f, 1.0000f}));
 c1.points.push_back(std::make_pair(1, geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.5878f, 0.8090f}));
 c1.points.push_back(std::make_pair(2, geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.9511f, 0.3090f}));

Code/src/Meshing/Circles2.cxx

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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+auto c1 = geo::Circle<float>{};
+c1.center = geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.0000f, 0.0000f};
 c1.points.push_back(std::make_pair(0, geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.0000f, 1.0000f}));
 c1.points.push_back(std::make_pair(1, geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.5878f, 0.8090f}));
 c1.points.push_back(std::make_pair(2, geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.9511f, 0.3090f}));

Code/src/Meshing/Circles3.cxx

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+auto c1 = geo::Circle<float>{};
+c1.center = geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.0000f, 0.0000f};
 c1.points.push_back(std::make_pair(0, geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.0000f, 1.0000f}));
 c1.points.push_back(std::make_pair(1, geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.5878f, 0.8090f}));
 c1.points.push_back(std::make_pair(2, geo::Vector3<float>{2.0000f, 0.9511f, 0.3090f}));

Code/src/Meshing/MainDisplay.cpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+#include <iostream>
+#include <vector>
 #include <memory>
 #include <cmath>
 #include <SFML/Window.hpp>

Code/src/Meshing/TestJunction3.cpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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+#include <iostream>
+#include <vector>
 #include <memory>
 #include <cmath>
 #include <SFML/Window.hpp>

Code/src/Meshing/TestJunction4.cpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+#include <iostream>
+#include <vector>
 #include <memory>
 #include <cmath>
 #include <SFML/Window.hpp>

Code/src/Meshing/main.cpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
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+#include <iostream>
+#include <string>
 
 #include "Geometry/Vector.hpp"
 #include "Geometry/Spline.hpp"

Code/src/SFMLTools/FreeFlyCamera.cpp

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+//
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+#include <iostream>
+#include <cmath>
 #include <GL/glu.h>
 #include <boost/algorithm/clamp.hpp>
 

Code/src/SFMLTools/JoyCam.cpp

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+#include <iostream>
+#include <cmath>
 #include <GL/glu.h>
 #include <boost/algorithm/clamp.hpp>
 

Code/src/Skeleton/Box.cpp

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+#include <iostream>
+#include <fstream>
 #include <Skeleton/Box.hpp>
 
 Box::Box() : m_x_min{}, m_x_max{}, m_y_min{}, m_y_max{}

Code/src/Skeleton/Branch.cpp

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+//
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+#include "Skeleton/Branch.hpp"
+
 bool Branch::operator==(Branch const& other)
 {
     if (size() == 2 && other.size() == 2)

Code/src/Skeleton/Skeleton.cpp

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+//
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+#include <iostream>
+#include <fstream>
 #include <algorithm>
 #include <valarray>
 #include <GL/gl.h>

Code/src/Skeleton/draw.cpp

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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 // 3. This notice may not be removed or altered from any source distribution.
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+#include <iostream>
+#include <vector>
 #include <memory>
 #include <cmath>
 #include <SFML/Window.hpp>

Code/src/Skeleton/init.cxx

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+//
 // Paella
 // Copyright (C) 2015 - Thomas FORGIONE, Emilie JALRAS, Marion LENFANT, Thierry MALON, Amandine PAILLOUX
 // Authors :
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+std::vector<std::pair<cv::KeyPoint,cv::KeyPoint>> keypoints1 = {
+    // Pairs of keypoints supposed to be matched with branche[0]
     {cv::KeyPoint{cv::Point{100,400},0}, cv::KeyPoint{cv::Point{400,400},0}},
     {cv::KeyPoint{cv::Point{200,200},0}, cv::KeyPoint{cv::Point{400,300},0}},
     {cv::KeyPoint{cv::Point{400,400},0}, cv::KeyPoint{cv::Point{500,300},0}},

Code/src/Skeleton/main.cpp

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 // Paella
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+#include <iostream>
+#include <fstream>
 #include <vector>
 #include <memory>
 #include <boost/program_options.hpp>